Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Sp3os-203ENSMUST00000137941 628 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxd11P23813 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm14692-201ENSMUST00000114672 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm1140-201ENSMUST00000114675 782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm19428-202ENSMUST00000220573 1038 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 4930579H20Rik-201ENSMUST00000187815 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Lrrc72-202ENSMUST00000122115 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxd11P23813 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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