Protein–RNA interactions for Protein: P23611

Irf8, Interferon regulatory factor 8, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf8P23611 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf8P23611 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf8P23611 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf8P23611 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf8P23611 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Irf8P23611 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms