Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Eif3aP23116 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Eif3aP23116 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms