Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tap1P21958 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms