Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SftpcP21841 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms