Protein–RNA interactions for Protein: P21440

Abcb4, Phosphatidylcholine translocator ABCB4, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb4P21440 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Abcb4P21440 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Abcb4P21440 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms