Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb9P20615 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb9P20615 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms