Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pou5f1P20263 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms