Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ntf3P20181 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ntf3P20181 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms