Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PdgfaP20033 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PdgfaP20033 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms