Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NefhP19246 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
NefhP19246 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
NefhP19246 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
NefhP19246 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NefhP19246 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NefhP19246 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms