Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csn1s1P19228 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Csn1s1P19228 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms