Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
P18528 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
P18528 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
P18528 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
P18528 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
P18528 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms