Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18527 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18527 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18527 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18527 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
P18527 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
P18527 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
P18527 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
P18527 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms