Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ass1P16460 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ass1P16460 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ass1P16460 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ass1P16460 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ass1P16460 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ass1P16460 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ass1P16460 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms