Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PrkceP16054 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms