Protein–RNA interactions for Protein: P16014

Chgb, Secretogranin-1, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgbP16014 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ChgbP16014 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ChgbP16014 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms