Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rag1P15919 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rag1P15919 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms