Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Znf271P15620 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Znf271P15620 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf271P15620 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Znf271P15620 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf271P15620 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf271P15620 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Znf271P15620 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf271P15620 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf271P15620 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf271P15620 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms