Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Vpreb2P13373 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Vpreb2P13373 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms