Protein–RNA interactions for Protein: P12960

Cntn1, Contactin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn1P12960 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cntn1P12960 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cntn1P12960 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms