Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 C130071C03Rik-203ENSMUST00000182788 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm27227-201ENSMUST00000183413 633 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Chrm1P12657 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms