Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp1P12032 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp1P12032 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timp1P12032 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms