Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Defa1P11477 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms