Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Tnp1P10856 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms