Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hoxd4P10628 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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