Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
P10404 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
P10404 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
P10404 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
P10404 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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