Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
LtaP09225 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LtaP09225 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LtaP09225 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LtaP09225 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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