Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxb7P09024 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxb7P09024 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms