Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprcP06800 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprcP06800 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PtprcP06800 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprcP06800 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprcP06800 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PtprcP06800 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprcP06800 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprcP06800 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprcP06800 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprcP06800 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprcP06800 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprcP06800 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms