Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxa4P06798 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms