Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06336 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06336 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06336 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06336 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06336 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06336 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06336 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06336 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06336 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P06336 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P06336 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P06336 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms