Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
P06320 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P06320 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P06320 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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