Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PdgfrbP05622 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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