Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04213 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04213 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04213 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P04213 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04213 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04213 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04213 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04213 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04213 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04213 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04213 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04213 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms