Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lamc1P02468 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lamc1P02468 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms