Protein–RNA interactions for Protein: P01740

T-cell receptor gamma chain V region V108A, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01740 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01740 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01740 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01740 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01740 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01740 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01740 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01740 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01740 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01740 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01740 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01740 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01740 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01740 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01740 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01740 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01740 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01740 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01740 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01740 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01740 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01740 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01740 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01740 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01740 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01740 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms