Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
P01735 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
P01735 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
P01735 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01735 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01735 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01735 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01735 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01735 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
P01735 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01735 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01735 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms