Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01678 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01678 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01678 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01678 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01678 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01678 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01678 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01678 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01678 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01678 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01678 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01678 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01678 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01678 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01678 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01678 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01678 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01678 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01678 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01678 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01678 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01678 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01678 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms