Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01664 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01664 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01664 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01664 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01664 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01664 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01664 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01664 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01664 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01664 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01664 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01664 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01664 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01664 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01664 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01664 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01664 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01664 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01664 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01664 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01664 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01664 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01664 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01664 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01664 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01664 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01664 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms