Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01659 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01659 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01659 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01659 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01659 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01659 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01659 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01659 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01659 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01659 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01659 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01659 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01659 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01659 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01659 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01659 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01659 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01659 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01659 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01659 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01659 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P01659 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms