Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P01638 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01638 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01638 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01638 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01638 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01638 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01638 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01638 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01638 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01638 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01638 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms