Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01636 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01636 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01636 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01636 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01636 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01636 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01636 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01636 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01636 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01636 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01636 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01636 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01636 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01636 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01636 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01636 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01636 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms