Protein–RNA interactions for Protein: O89020

Afm, Afamin, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfmO89020 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AfmO89020 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AfmO89020 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
AfmO89020 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AfmO89020 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AfmO89020 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AfmO89020 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AfmO89020 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AfmO89020 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AfmO89020 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AfmO89020 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AfmO89020 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AfmO89020 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AfmO89020 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AfmO89020 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AfmO89020 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AfmO89020 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AfmO89020 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AfmO89020 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AfmO89020 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AfmO89020 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
AfmO89020 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AfmO89020 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AfmO89020 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AfmO89020 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AfmO89020 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AfmO89020 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AfmO89020 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AfmO89020 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AfmO89020 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AfmO89020 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms