Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CcnkO88874 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CcnkO88874 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CcnkO88874 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CcnkO88874 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CcnkO88874 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CcnkO88874 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CcnkO88874 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CcnkO88874 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CcnkO88874 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnkO88874 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CcnkO88874 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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