Protein–RNA interactions for Protein: O88822

Sc5d, Lathosterol oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sc5dO88822 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sc5dO88822 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms