Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1O88746 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tom1O88746 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1O88746 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1O88746 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tom1O88746 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms