Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BlmO88700 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BlmO88700 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BlmO88700 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BlmO88700 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BlmO88700 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BlmO88700 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BlmO88700 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BlmO88700 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BlmO88700 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BlmO88700 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BlmO88700 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BlmO88700 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
BlmO88700 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BlmO88700 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BlmO88700 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BlmO88700 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BlmO88700 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BlmO88700 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BlmO88700 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BlmO88700 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BlmO88700 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BlmO88700 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BlmO88700 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BlmO88700 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BlmO88700 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BlmO88700 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BlmO88700 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BlmO88700 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BlmO88700 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BlmO88700 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BlmO88700 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BlmO88700 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BlmO88700 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BlmO88700 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BlmO88700 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BlmO88700 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BlmO88700 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BlmO88700 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BlmO88700 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BlmO88700 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BlmO88700 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BlmO88700 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BlmO88700 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BlmO88700 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BlmO88700 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BlmO88700 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BlmO88700 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BlmO88700 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BlmO88700 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BlmO88700 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BlmO88700 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BlmO88700 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BlmO88700 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BlmO88700 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BlmO88700 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BlmO88700 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BlmO88700 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BlmO88700 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BlmO88700 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BlmO88700 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BlmO88700 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms