Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnmt3aO88508 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnmt3aO88508 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms