Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme6O88425 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme6O88425 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme6O88425 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nme6O88425 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nme6O88425 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nme6O88425 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nme6O88425 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nme6O88425 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nme6O88425 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nme6O88425 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nme6O88425 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.3 ms